خلاصة:
سابقه و هدف: سرطان سینه شایعترین نوع سرطان و عمده ترین دلیل مرگ ناشی از سرطان در زنان سراسر دنیا است. تعیین عوامل موثر در این بیماری یکی از دغدغه های جامعه پزشکی امروز است. عوامل ژنتیکی یکی از موثرترین عوامل در بروز سرطان سینه هستند. برخی گزارشات پزشکی به طور انتزاعی به نقش برخی از ژن ها در این بیماری اشاره کرده اند. در این پژوهش با توجه به عدم وجود اطلاعات کافی و معتبر برای مدل سازی ریاضی درباره بیان ژن های شناخته شده در این نوع سرطان، اطلاعات مورد نیاز برای مدل سازی درباره تغییرات بیان ژنی از سایت NCBI جمع آوری گردید.
مواد و روشها: این پژوهش به روش توصیفی روی مجموعه داده های بیان ژنی حاصل از تجزیه و تحلیل ریزآرایه مربوط به 5 فرد سالم و 28 بیمار مبتلا به سرطان سلول های استرومای سینه موجود در سایت NCBI صورت گرفت. مدل سازی بر روی بیان 22277 ژن مرتبط با این نوع سرطان صورت گرفت. در این مدل، هر ژن به عنوان یک بازیکن در بازی TU در نظر گرفته شد و سهم مشارکت هر یک از ژن ها در این نوع سرطان محاسبه گردید. سرانجام 200 ژن که سهم بیشتری داشتند انتخاب و رتبه بندی شدند.
یافته ها: نتایج این پژوهش دال بر این هستند که بیش از 200 ژن سهم مشارکتی بالایی در بروز این نوع سرطان دارند، اما تغییر در بیان ژن های DDR1، SLC23A2 و PADI2 به ترتیب بالاترین سهم مشارکت در بروز سرطان در سلول های استرومای سینه را در مقایسه با دیگر ژن ها در این نوع سرطان دارا می باشند.
نتیجه گیری: به نظر می رسد که تغییر در بیان تعدادی از ژن ها در این نوع سرطان به وقوع می پیوندد. در تایید یافته ما، نقش تغییر در بیان ژن های DDR1 و PADI2 در بروز این نوع سرطان به طور تجربی در پژوهشهای قبلی نشان داده شده است. اما این پژوهش از نظر رتبه بندی بیان ژن هایی که در سرطان سینه دچار تغییر می شوند، منحصر به فرد است. این رتبه بندی بیان ژنی دارای ارزش پشتیبانی بالایی در تصمیم گیری برای تشخیص و درمان سرطان است. تصمیم گیری نهایی در ارتباط با صحت طبقه بندی ما منوط به نتایج پژوهشهای تحلیلی در ارتباط با تعیین سهم ژن های دخیل در بروز سرطان سینه است.
Background and Aim: Breast cancer is one of the prevailing types of cancers and main cause of death in women suffering from cancer. Determination of factors involved in the development of this disease is one of the main challenges of modern medical society. Genetic factors are effective factors in generation of breast cancer and the role of some genes in this disease were denoted in some medical reports. Regarding restriction of valid information on changes in genes expression in this type of cancer for mathematical modeling، in this study، genes expression information that were needed for modeling was obtained from the NCBI website.
Materials and Methods: In this descriptive study، the dataset of gene expression derived from microarray analysis of 5 healthy individual and 28 patients with breast stromal cell cancer was gathered from NCBI website. Then، expression of 22277 genes related to this type of cancer was modeled. In this model، each gene was considered as a player in transferable utility (TU) game and contribution rate of each gene in this type of cancer was calculated. Finally 200 genes with high contribution rate were chosen and ranked.
Results: The results of this research indicate that more than 200 genes have high contribution rate in incidence of this type of cancer. However، changes in DDR1، SLC23A2 and PADI2 genes expression have the highest contribution rate comapred with other genes in breast stromal cells cancer.
Conclusion: It seems that changes in expression of many genes are participating in this type of cancer. In support of our findings، the role of expression change in DDR1 and PADI2 genes in this type of cancer were shown experimentally in previous studies. But، this research is unique for assortment of genes with expression change in breast cancer. This ranking of gene expression has decision supporting value in the diagnosis and treatment of cancer. Final decision about accuracy of our classification is certainly subject to confirmation by future analytical experiments on expression of genes that participate in breast cancer.
(
, 
, 
)
