خلاصة:
سابقه و هدف: شکوفایی سیانوباکتری ها در آب های سطحی منجر به تولید سیانوتوکسین های خطرناکی مثل میکروسیستین می شود که مشکلات قابل توجهی ایجاد می کنند. در مطالعه ی حاضر، از یک آزمون PCR بهینه شده برای شناسایی سیانوباکتری های تولید کننده ی میکروسیستین موجود در تالاب انزلی استفاده شده است.
مواد و روش ها: نمونه گیری آب از 20 ایستگاه واقع در نواحی شرقی، مرکزی و غربی تالاب انزلی صورت گرفت. استخراج DNA با استفاده از کیت DNG-Plus انجام گرفت. آزمون PCR برای پرایمرهای جهانی سیانوباکتری ها (23S30R و CYA106F) و پرایمر اختصاصی ژن کدکننده ی میکروسیستین (mcyA-Cd1F و mcyA-Cd1R) بهینه شده و حساسیت و اختصاصیت آن ارزیابی گردید. سپس، آزمون PCR بهینه شده برای نمونه های تالاب انزلی به کار گرفته شد. فرایند کلونینگ محصولات PCR با توجه به رهنمودهای سازنده ی کیت انجام گرفت.
یافته ها: مناسب ترین دما برای مرحله ی انیلینگ، واکنش 56 درجه سانتی گراد بود. بیشترین میزان تکثیر DNA زمانی در غلظت 4/0 میکرومولار پرایمرها مشاهده شد. به کارگیری آزمون PCR بهینه شده روی نمونه های تالاب انزلی آشکار کرد که همه ی ایستگاه های مورد مطالعه، آلوده به سیانوباکتری بودند که از بین آنها، سیانوباکتری های تولید کننده ی میکروسیستین در 10 ایستگاه حضور داشتند. محصولات PCR با موفقیت کلون شده و برای مطالعات آتی ذخیره گردید.
نتیجه گیری: ممکن است تالاب انزلی در معرض خطر غلبه سیانوباکتری ها قرار گرفته باشد. از آزمون PCR بهینه شده در این مطالعه می توان به عنوان یک ابزار کارآمد به منظور مونیتورینگ و کنترل سیانوباکتری ها، به خصوص جهت شناسایی سویه های تولید کننده ی میکروسیستین در تالاب ها و یا سایر منابع آبی استفاده کرد.
Background and Aim: Production of dangerous cyanotoxins such as microcystin، resulted from cyanobacteria bloom in territorial waters، could cause worldwide issues. We optimized and implemented a PCR method for detection of microcystin-producing cyanobacteria in Anzali Lagoon.
Materials and Methods: Sampling was performed from 20 stations within western، central and eastern parts of the Lagoon. DNA was extracted using DNG-Plus kits. Optimization of PCR test for two universal (23S30R، CYA106F) and two specific primers (mcyA-Cd1F، mcyA-Cd1R) achieved، and its sensitivity and specificity were evaluated. Moreover، the test was applied for samples from Anzali Lagoon.
Results: Optimum PCR yield was obtained at 56 C، and in 0.4 μM concentrations of the primers. Optimized PCR method revealed، which cyanobacteria were present in samples from all of the studied stations of Anzali Lagoon. In addition، microcystin-producing cyanobacteria were observed in 10 out of 20 stations.
Conclusion: Anzali Lagoon may have been predominated by dangerous cyanobacteria، and our optimized PCR method can be exerted as an efficient tool for monitoring of microcystin-producing species of cyanobacteria in the lagoons and other water sources.