بررسی جهش های اگزونی ژن NOD2 در بیماران ایرانی مبتلا به کرون Journal Article

سابقه و هدف: ژن NOD2 به عنوان ژنی که ارتباطی قوی با بیماری کرون دارد، شناخته شده است. ولی جهش های این ژن در جمعیتهای مختلف، فراوانی های متفاوتی را نشان داده اند. هدف از مطالعه حاضر، تعیین توالی تمام اگزون های ژن NOD2 در بیماران ایرانی مبتلا به کرون بود تا جهش های موجود در این ژن را بیابیم و فراوانی هریک از آنها را در بیماری کرون در مقایسه با افراد شاهد بررسی نماییم. مواد و روش ها: در مطالعه تحلیلی مورد-شاهدی 90 بیمار کرون و 120 فرد سالم که از نظر سن و جنس با بیماران همسان بودند، مورد بررسی قرار گرفتند. این افراد در طی سه سال (1388-1386) به بیمارستان طالقانی وابسته به دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی مراجعه کرده بودند. تمام مناطق اگزونی ژن NOD2 در این افراد به روش PCR (polymerase chain reaction) وsequencing مورد بررسی قرار گرفت و در دو گروه بیمار و شاهد مقایسه شد. یافته ها: 21 جهش در تمام اگزون های ژن NOD2 یافت گردید که 8 عدد از این جهش ها فراوانی آللی بیش از 5% داشتند. هشت موتاسیون جدید (یکی در اگزون 2 و 7 عدد در اگزون 4) یافت شد. سه جهش شایع ژن NOD2 (G908R، R702W و 1007fs) به ترتیب فراوانی آللی برابر با 3/2%، 3/13% و 7/1% داشتند. سه جهش جدید P371T، A794P و Q908H و نیز جهش R702W در بیماران کرون به شکل معنی داری فراوان تر از گروه شاهد بود (001/0>p). نتیجه گیری: 8 جهش جدید در ژن NOD2 یافت شد ولی هنوز اهمیت پاتوفیزیولوژیک این جهش ها نامشخص است. بر اساس این مطالعه به نظر می رسد بیماران ایرانی با گنجینه ژنتیکی متفاوت ممکن است خصوصیات جدیدی را برای حساسیت به بیماری داشته باشند.

Background and Aim: The NOD2 gene is known to have a strong association with Crohn’s disease، but different trends were reported in occurrence of NOD2 variants in distinct ethnicities. The aim of this study was to assess all exonic sequences of the NOD2 gene in Iranian Crohn's patients and healthy controls to identify any existing variation and evaluate their association with Crohn's disease. Materials and Methods: In the present study 90 non-related Crohn's patients and 120 sex- and age- matched healthy controls were included. They were referred to a tertiary center in a three-year period (2006-2009). The exonic regions of the NOD2 gene were amplified by polymerase chain reaction and evaluated by direct sequencing. Results: Totally، 21 sequence variations were identified among all exonic regions of the NOD2 gene، among which 8 had an allele frequency more than 5%. Eight new mutations (1 in exon 2 and 7 in exon 4) were observed. The three main variants (R702W، G908R، and 1007fs) showed allele frequencies of 13.3%، 2.2%، and 1.7%، respectively. Three new variations (P371T، A794P، and Q908H) and R702W mutation were significantly more frequent in Crohn's patients compared to controls. Conclusion: Eight novel mutations were identified in the NOD2 exons، but the patho-physiological importance of these variants remains unclear. Iranian patients with their different genetic reservoir may demonstrate some novel characteristics for disease susceptibility.