Abstract:
سابقه و هدف: به دلیل ارزش غذایی ماهی سوکلا و اهمیت آن از نظر رشد سریع در شرایط پرورشی و ارزش تجاری قابل توجه و نیز فقدان پیشینه مطالعاتی کافی، در این پژوهش پلی مورفیسم ژنومی این گونه در آبهای جنوبی کشور در سال 1389 بررسی گردید تا تنوع ژنتیکی و میزان آن در درون و مابین جمعیتهای احتمالی مشخص گردد.
مواد و روشها: تحقیق به روش Cross sectional و بر روی 120 نمونه ماهی سوکلا انجام گردید که از آبهای چهار منطقه سیستان و بلوچستان، هرمزگان، بوشهر و خوزستان به صورت تصادفی جمع آوری شده بودند. برای این منظور، 2 گرم از بافت باله هر ماهی جدا گردید و درون میکروتیوب های 2 میلی لیتری حاوی اتانول به آزمایشگاه انتقال یافت. استخراج DNA به روش فنل کلروفرم و بررسی پلی مورفیسم ژنومی با استفاده از روش PCR-RFLP انجام گردید. در این روش، محصول PCR ژن میتوکندریایی سیتوکروم اکسیداز I، با استفاده از 6 آنزیم برشی Restriction Enzyme) یا (Cutting Enzyme مورد هضم آنزیمی قرار گرفت.
یافته ها: در این تحقیق محصول PCR ژن CoI، به طول 1060 جفت باز به دست آمد و 6 جایگاه پلی مورفیک بررسی گردید، لیکن الگوی الکتروفورز محصولات هضم آنزیمی، در تمام نمونه ها هم شکل (مونومورف) بود و پلی مورفیسم (چندشکلی) مشاهده نگردید.
نتیجه گیری: به طور کلی عدم تنوع ژنتیکی و یا کاهش قابل توجه آن بین ماهیان، در مناطقی که امکان مهاجرت و جابجایی آنها از منطقه ای به منطقه دیگر (جریان ژنی) وجود دارد، گزارش گردیده است. ماهی سوکلا نیز که ماهی مهاجر است، به دلیل عدم وجود موانع فیزیکی و زیستی می تواند در سراسر خلیج فارس و دریای عمان مهاجرت نماید. بر این اساس، عدم مشاهده پلی مورفیسم در جمعیت ماهی سوکلای آبهای شمالی خلیج فارس و دریای عمان در پژوهش حاضر، ممکن است دور از واقعیت نباشد. بدیهی است استفاده از سایر نواحی ژنی و تعداد نمونه ها و آنزیم های بیشتر می تواند نتایج دقیق تری را نشان دهد.
Background and Aim: Given the nutritious value of Cobia and its importance in terms of rapid growth in cultural conditions and noticeable commercial value، along with lack of sufficient literature in this regard، this study was run to investigate genomic polymorphism of this species in southern waters of Iran in 2010. The study aimed at enlightening genetic variation and determining its rate inside and between probable populations.
Materials and Methods: This cross sectional study was carried out on 120 specimens of Cobia which were randomly obtained from four southern Iranian provinces. Two-gram cuts of fin tissue of each fish were transferred to the laboratory in 2 ml microtubes containing ethanol. DNA was extracted by Phenol-chlorophorm method and genomic polymorphism investigation was carried out by PCR-RFLP method. In this method، PCR product of COI mitochondrial gene were enzymatic digested using 6 Restriction Enzymes.
Results: PCR product of mitochondrial gene COI was obtained in length of 1060 base pair and 6 polymoiphic sites were investigated. But electrophoresis patterns of enzymatic digestion products were monomorphous in all samples and no polymorphism was observed.
Conclusion: Lack of genetic diversity or its noticeable decrease in regions where fish can freely migrate and move between two regions has been reported. Due to lack of physical and biological obstacles Dobia is able to migrate to all parts of the Persian Gulf and Oman Sea. Therefore، lack of polymorphism in the studied Cobia population seems to be logical. Future studies with larger samples and more enzymes from other genetic regions are recommended.