Abstract:
ارزیابی و حفاظت از مرغان بومی به عنوان منابع ژنتیکی، برای بهبود آنها در آینده ضروری است. یکی از راههای شناسایی این نژادها استفاده از تکنیکهای مولکولی بخصوص استفاده از ژنوم میتوکندری است. در این تحقیق تنوع ژنتیکی مرغان بومی گردن لخت با استفاده از تجزیه و تحلیل توالی ژنوم میتوکندری بررسی شد. برای انجام این تحقیق یک قطعه 455 جفت بازی از بخش HVR-I ناحیه D-LOOP ژنوم میتوکندری در 20 مرغ گردن لخت پس از تکثیر توسط پرایمرهای اختصاصی توالییابی شد. در کل 2 هاپلوتیپ شناسایی شد. که این هاپلوتیپها از جانشینی 4 نوکلئوتید ایجاد شدهاند. تنوع 0 بدست /002356±0/ 0 و 0031 /01591±0/ هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی در مرغان بومی گردن لخت به ترتیب 3556 آمد. برای مشخص شدن رابطه این نژاد با سایر نژادهای گرفته شده از بانک جهانی ژن و پس از رسم درخت فیلوژنی برای ناحیه موردنظر مشخص شد که مرغ گردن لخت در گروه مرغ پیلموتراک و سونراتی قرار دارد که این نزدیکی ممکن است به دلیل مشابهت ژنتیکی نژاد گردن لخت با این نژادها باشد.
Machine summary:
"/ شکل ١- نمودار فیلوژنی (نمودار درختی NJ) توالی کلی مرغ بومی گردن لخت و ١٦ نژاد اخذ شده از بانک جهانی ژن به همراه کد دسترسی آن ها ٤- نتیجه گیری با استفاده از توالی یابی بخش HVR-I ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری تنوع ژنتیکی پایین در جمعیت مرغان گردن لخت مشاهده شد.
با توجه به اینکه نژاد گردن لخت در گروه مرغان پیلموت راک و سونراتی قرار گرفته است بنابراین واجد برخی شباهت ها با این نژادها می باشد به همین دلیل این نژاد قابلیت اصلاح نژادی را دارا است که با توجه به مقاوم بودن آن به شرایط ایران و پرورش روستایی می تواند با قابلیت های بهتر به منظور تامین نیاز روستائیان مورد استفاده قرار گیرد.
جدول شماره ٢- تعداد هاپلوتیپ ، درصد فراوانی نسبی نوکلئوتیدها، تنوع نوکلئوتیدی و هاپلوتیپی ناحیه HVR-I مرغ گردن لخت جمعیت تعداد تعداد % تنوع تنوع نمونه هاپلوتیپ A G C T نوکلئوتیدی هاپلوتیپی مرغ گردن لخت 10 2 29/2 13/03 27/39 30/34 0/002356±0/0031 0/01591±0/3556 شکل ١ نمودار فیلوژنی رسم شده از توالی کلی بخش HVR-I ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری مرغ بومی گردن لخت و توالی های مشابه از ١٦ نژاد گرفته شده از بانک جهانی ژن به همرا کد دسترسی آن ها را نشان می دهد.
لذا هدف از این مطالعه تجزیه و تحلیل مولکولی جمعیتی از مرغ بومی گردن لخت با استفاده از توالی ناحیه HVR-I ژنوم میتوکندری و یافتن جایگاه این نژاد در بین سایر نژادهایی از مرغ بود که اطلاعات آن ها در بانک جهانی ژن موجود می باشد."